基因治疗联合干细胞移植有以下优点：

将基因修饰的干细胞移植到坏死心肌区域，不仅可以替代坏死心肌细胞发挥功能，还能表达新生血管生成所需要的生长因子，从而有利于坏死区及周围血管的生成，这对于移植细胞存活和心脏功能改善都有重要意义。

干细胞移植为了达到治疗数量，往往需在体外进行细胞的培养扩增，有的所需时间长，而且经过反复传代后，细胞易于老化，甚至表型发生改变，造成定向诱导分化困难。基因转染细胞能减少治疗所需的细胞数量，而且还能有利于细胞的定向诱导分化。

基因治疗所面临的重要问题之一，便是作为基因载体的病毒的免疫反应性，而体外转染细胞，能避免病毒暴露给移植治疗对象的免疫系统，理论上也许能够减少由于免疫反应所产生的毒性。

当然，基因治疗联合干细胞移植也存在一些问题，比如选择载体的有效的转染率，以及治疗的安全性和准确性等等，尤其安全性的问题必需引起高度重视。某些基因在其表达水平超出一定范围后可能会从有益变为有害,Lee等将编码VEGF基因的逆转病毒感染成肌细胞，然后注射到免疫缺陷大鼠心室壁，VEGF不受调控而持续表达，术后两周内所有大鼠心室移植部位均形成了内皮细胞起源的血管瘤，大鼠不能健康生长，其中一半死亡。

总之，基因治疗联合干细胞移植是坏死心肌修复的一个积极有效的治疗手段，但由于对其安全性还缺乏足够的认识，因此对于这方面的研究和应用，应谨慎科学，避免轻率盲从。